Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN1O94985 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms