Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG12O94817 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms