Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL5O76039 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms