Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY75O60449 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY75O60449 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LY75O60449 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LY75O60449 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LY75O60449 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LY75O60449 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LY75O60449 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LY75O60449 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LY75O60449 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms