Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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