Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDIL3O43854 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms