Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPAA1O43292 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms