Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms