Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2DO15399 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN2DO15399 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms