Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3EO15041 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3EO15041 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms