Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRTO14522 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRTO14522 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
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