Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
APOC4-APOC2K7ER74 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms