Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms