Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATL2C9JE40 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PATL2C9JE40 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms