Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HNRNPCL3B7ZW38 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HNRNPCL3B7ZW38 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms