Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DEV8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DEV8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DEV8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DEV8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms