Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms