Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms