Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms