Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STRCP1A6NGW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms