Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms