Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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