Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LHX8Q68G74 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms