Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms