Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CBFBQ13951 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms