Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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