Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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