Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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