Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN13Q12923 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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