Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 GJB2-201ENST00000382844 2309 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CACNB1Q02641 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms