Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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