Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CTF1Q16619 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms