Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPN13Q12923 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPN13Q12923 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPN13Q12923 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN13Q12923 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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