Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FXNQ16595 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FXNQ16595 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms