Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.6 ms