Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms