Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IMPG1Q17R60 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms