Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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PTPRRQ15256 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRRQ15256 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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