Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms