Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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