Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC61Q9Y6R9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms