Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSSC4Q9Y5U2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSSC4Q9Y5U2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms