Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NRXN3Q9Y4C0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms