Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HCN4Q9Y3Q4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HCN4Q9Y3Q4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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