Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP58Q9Y2X3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP58Q9Y2X3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms