Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms