Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT1Q9Y234 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT1Q9Y234 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms