Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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