Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms