Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL4Q9UJQ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms